錆びてしまったヨーヨーは、最初の綺麗な頃には戻れないのでしょうか?程度で言うと、黒ずんできた頃のです。
奥まで浸透したサビを落とすのは非常に困難です。
磨き布やピカールといった研磨剤は、表面の酸化を削り取るのみですので、それ以上のサビを取り除くことができません。工業用の錆取り材が必要になる可能性があります（当店での取扱予定はございません）。
サビ取りレーザーというのもあるようですが、費用があまりに高額で現実的ではありません。
サビを取る＝削り取る＝バランスが崩れることでもあるので、あまりに浸透したサビは諦め、表面のサビを定期的に取り、今以上サビを作らないようにするのが現実的ではないかと思います。